贮藏奶酪需要遵循一个基本原则：水份含量低（含水量低于50%）的奶酪，可以在较高温度下贮藏；而水份含量高（含水量高于50%）的奶酪，则应该在低位环境下贮藏。然而，为了奶酪的高质量并尽可能地延长贮藏期，遵循更具体的贮藏、常温保存及冷冻的原则是非常重要的。

贮藏期限

水份含量和成分是影响奶酪的主要因素。一般来说，柔软、含水量高的奶酪，如乳脂奶酪，贮藏期限较短。而硬奶酪，如切达奶酪，如果处理和存放得当，贮藏期限可以较长。奶酪粉（干奶酪）和干的混合奶酪的贮藏期限为6—9个月。

质量期

为了帮助购买者估算奶酪的贮藏期限，制造商会在奶酪的零售包装上标注质量期。美国法律不强制规定要标注质量期，但这是奶酪制造商对于奶酪具有佳风味和质地的时期的估算。但即使过了这个日期，奶酪也可放心食用。

常温摆放

经证明，将大量选购商品陈列展示可以增加销量。硬质奶酪，如帕马森奶酪、罗马诺奶酪、切达奶酪和科尔比奶酪，可以常温摆放，以促进零售，或作为产品展示和样品陈放。

大量散装陈列的奶酪或靠近样品展示台的奶酪必须用塑料薄膜紧紧包着或是出厂原装摆放。产品应避免阳光直射，远离高温，且只能短期陈列。

冷冻奶酪

一般不建议冷冻奶酪，因为冷冻的过程会使奶酪的质地变成粒状或粉状，这种质地的奶酪更适于烹饪而不是单独食用。大多数奶酪不应冷冻，但如果真有必要，则应注意以下一些指引：

奶酪应尽快冷冻到-23℃；冷冻奶酪应在0—1℃的冷藏环境下放置数天以解冻；

解冻后，奶酪应在0—1℃的环境下贮藏10天，这个过程被称为“回性处理”，以确保奶酪的质地和融化性没有因为冷冻贮藏而受到太大的影响；

为使口味佳，奶酪的冷冻时间不得超过数月；

有些奶酪冷冻过后会更好，不过这因奶酪种类而异。有些通过霉菌成熟的奶酪，包括半成熟奶酪、蓝霉奶酪和水洗奶酪在冷冻及解冻后，有益菌会被杀死，不会再继续生长。因此冷冻奶酪前，请向经销商或生产商征询具体的冷冻方法。